Planeta Curioso

Pues en el fondo del mar, ¡también! Al menos eso es lo que han encontrado los investigadores William Orsi y Virginia Edgcomb del Departamento de Geología y Geofísica de la Institución Oceanográfica Woods Hole y su colega Jennifer F. Bidle de la Universidad de Delaware, cuando han analizado mediante procedimientos metagenómicos los sedimentos marinos de diferentes localizaciones oceánicas. Su idea era considerar el 18S RNA ribosomal para identificar a los microorganismos eucariotas presentes en dichos fondos. Y se han encontrado con que hay hongos en todos los sitios, desde las dorsales oceánicas a las llanuras abisales pasando por los márgenes continentales. Gráfico que presenta los cinco grupos taxonómicos eucariotas más abundantes encontrados en el estudio de los sedimentos marinos realizado por Pero una cosa es descubrir un gen que codifica para un RNA ribosomal y otra muy diferente es demostrar que proviene de un ser vivo metabólicamente activo. El DNA es una molécula muy estable y quizás pudiera provenir de microorganismos muertos, en manera latente, o inclusive de tiempos remotos (es lo que se conoce como ). De hecho, hace una década ya se habían detectado que había hongos en los sedimentos marinos, e inclusive se habían conseguido aumentar en el laboratorio. Pero se pensaba que no eran muy usuales y que algunos podrían provenir simplemente de esporas latentes presentes en dichos sedimentos. La novedad del presente estudio es que primero han aislado RNA ribosomal de los sedimentos. De esa forma, en creencia sólo han podido muestrear microorganismos que tuvieran ribosomas funcionales, lo que supone que esas células estaban metabólicamente activas. Tras usar transcritasa reversa, han realizado una PCR para ampliar y despues secuenciar los RNA ribosomales. Así se ha podido correlacionar la presencia de variadas poblaciones de hongos con las porciónes de carbono orgánico total TOC), nitratos, sulfuro y carbono inorgánico disuelto DIC). Sin importar el espacio donde se han tomado las muestras, lo que se ha encontrado es que los perfiles químicos se correspondían con los perfiles biológicos. Diversidad del RNA ribosomal pirosecuenciado encontrado en cinco localizaciones diferentes que representan los diferentes tipos de fondos marinos (NP: North Pond cerca de la dorsal oceánica del Atlántico, EEP: Pacífico Ecuatorial Oriental, BSP: Corriente de Benguela en África, HR: Cresta de los hidratos de gas en el Pacífico noroeste, PM: Márgenes de Perú). En la fracción sobresaliente se presenta el porcentaje de secuencias leídas (eje y) y el color indica el tipo de organismo eucariota al que pertenecen. En la fracción inferior, el dendrograma presenta el agrupamiento jerarquico de las presentas. Los círculos verdes representan la porción de carbono orgánico total de la presenta. Fuente de la imagen: Evidentemente, de confirmarse el hallazgo habrá que recalcular determinadas de las tasas de renovación de los fundamentos en los ciclos biogeoquímicos. Hasta ahora se pensaba que las actividades heterotróficas de los fondos marinos estaban realizadas exclusivamente por procariotas. La presencia de hongos significa que puede haber nuevas capacidades degradativas que movilicen recursos y nutrientes de manera parecida a lo que ocurre en los suelos terrestres. Los investigadores asimismo han encontrado un dato bastante curioso en sus análisis. Han conseguido identificar RNAs ribosomales provenientes de plantas y diatomeas presentes en sedimentos que se maneraron en tiempos remotos, concretamente con edades entre los 0'03 y los 2'7 millones de años, lo que sugiere que el RNA ribosomal de algunos taxones eucariotas es mucho más estable de lo que se pensaba. Es decir, asimismo de un Paleoma para el DNA, hay que pensar que puede existir un Paleoma de RNA ribosomal. Esta acceso participa en el XXII carnaval de la Química alojado en La enciclopedia galáctica Orsi W, Biddle JF, & Edgcomb V (2013). Deep Sequencing of Subseafloor Eukaryotic rRNA Reveals Active Fungi across Marine Subsurface Provinces.